Esos cambios son muy relativos. Son cambios muy importantes y si comparamos el kernel como el cerebro de una ROM, el framework, sytemUI y lidroid se pueden copara con el corazon, riñones, etc...
Siempre puedes hacer un trasplante, pero el cuerpo tambien puede rechazar este. Pues en una ROM pasa igual, puedes cambiar estos apks que son muy importantes, pero si no son compatible (en este caso la misma base) las consecuencias a corto plazo pueden ser incontrolables.
El lidroid en este caso no solo debe estar preparado y optimizado a la base, es posible que el framework-res.apk o algun que otro .JAR necesiten tambien estar editados a la vez y acorde con alguna de las opciones para ambos, incluso en ciertos caso el sytemUI.apk tambien necesita estar editado para no dar errores todo en conjunto.
Si alguno de estos 3 o 4 archivos (depende como dije si necesita tambien de alguo de los .jar que estan en /system/framework estar editados para alguno de los toggles) no estan adaptados entre si puede dar fallos como el de drenar la bateria y puede ser el menor de tus problemas a medio/largo plazo.
Las muchisimas pruebas que he echo con las varias SAMMYS que he colaborado tanto en el S2, como galaxy ace si esta todo acorde y bien echo nunca vi mas consumo por mucho toggle extra que lleve. Y mas de una las probe con el lidroid original y con alguno editado con mas toggles de los originales que llevo la ROM en cuestion finalmente salvo alguna excepcion.
Obviamente si llevas un toggle de 2G/3G en la ROM consumira mas en 3G que en 2G, pero vamos que no voy a descubriros la rueda a estas alturas y por todos es sabido esto.