Hola , yo pase por lo mismo y te recomiendo que hagas lo que yo hice a mi me funciono perfecto
Lo que puedes hacer es :
primero: particionar tu nueva memoria a Fat32, Ext 3 o 4 (yo actualmente tengo una de 16 gb con Ext 4 ) y Swap ,
Segundo: crear un backup de tu rom actual con nandroid desde el cwm ( entras a recovery vas a backup and restore > backup)
tercero: copiar la carpeta "clockworkmod" de la raiz de tu sd actual y Pasarla a la raiz de tu nueva SD
Cuarto : Saca tu sd actual y mete la de 16 GB
quinto: Entra a recovery y aplica wipe cahe partition , wipe factory , ve a advanced> wipe dalvik cache, ve a mounts and storage> format system ( no se si todo esto sea necesario , pero yo siempre lo hago de esta forma y no he tenido problemas)
Y por ultimo: Ve a backup and restore > restore > seleccionas el backup que creaste anteriormente y listo , te restaura todo tal como lo tenias,
espero te sirva , saludos