Problema en el almacenamiento

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Resulta que desde que actualicé a la última build de CM13 oficial, hay archivos (como música o fotos) que no me detecta estando en la SD o en la memoria interna. Al conectarlo al PC, este me reconoce el dispositivo pero al abrir la carpeta de memoria interna o la externa aparece como vacía. Decir que desde el ordenador solamente aparecen los archivos cuando estoy dentro del recovery.
He probado a formatear la SD y la memoria interna y nada.

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Al parecer el explorador de archivos del móvil sí que las lee e incluso las puede reproducir. El problema está con las apps de música. He probado en una Rom MIUI y sí que me las encuentra la aplicación de música nativa