Problema recompilando archivo img

[connerESP]

Tengo una ROM de mediatek preparada para instalar con SPFlashtools. Si la cargo al teléfono funciona sin problemas. Quiero editar el system.img y modificar el build.prop. Utilizo el MTK Thai Developer Tools para desempaquetar el system.img. Lo hago sin errores y puedo cambiar lo que quiera. Luego lo empaqueto de nuevo con la misma herramienta y el system.img nuevo que me ha dado lo cargo en el teléfono con Sp Flashtools. La ROM se carha sin problemas pero el teléfono no arranca. Hice la prueba de desempaquetar el system y volverlo a empaquetar y Flashearlo y el teléfono tampoco arranca. Qué hago mal? Hay que hacerle algo al archivo reempaquetado antes de poder cargarlo con el Flashtools?
Si lo estoy haciendo mal, alguien me puede guiar sobre como reempaquetar el archivo para que sea válido para Flashtools?
Cualquier ayuda será bienvenida.