Puede ser, pero sería absurdo... La memoria del telefono y la de la tarjeta interna son la misma unidad, lo que dos particiones diferentes... Puede ser que se te haya formateado la tarjeta interna con otro formato que no sea?
Pera que enchufo mi SCL al PC...
Ok, la SD interna tiene que ser FAT a secas, y la externa FAT32.
Si puedes mirar el formato de las memorias a través del PC, fijate que la interna sea FAT. Si es FAT16 o FAT32, o NTFS, formateala con algún programa (en el tutorial XDAndroid de mi firma tienes un enlace a un programa muy bueno) y reflashea.
Al formatear acuerdate bien de seleccionar FAT a secas, sin ningún numero!