Lo de root ya te lo han explicado. Ademas dices que has usado el Wotan, pero...... ¿has usado el UnlockRoot a continuacion? (Una cosa no tiene que ver con la otra).
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=340757
Para copiar la SD, tienes que ir a Panel de Control-Opciones de Carpeta-Ver-Mostrar todos los archivos y carpetas ocultas-Aplicar.
Conecta el movil por USB con el PC Companion, entras en la tarjeta SD y copias todo su contenido a alguna carpeta nueva que creas en tu PC. Insertas la tarjeta nueva y copias en ella el contenido de la carpeta del PC.
No parece dificil verdad¿?¿?¿?¿?¿? Pues no deveria de serlo.