Hay que montar como r/w la partición /system. Bien desde ADB vía PC con el comando
adb remount o usando desde el Desire un programa gestor de archivos a nivel root como RootExplorer. O de otro modo, sustituyendo el archivo build.prop en el ZIP de la ROM, firmarlo o no, y volver a instalar el ZIP modificado.
@kelones. ¿Usabas antes el S2E para las aplicaciones? Comprueba que tengas dados permisos de root a S2E, desde la aplicación Superuser. Wipe de DATA borrará todos los datos de tus aplicaciones. Lee bien el primer mensaje. Una actualización solo es wipe-cache y wipe-dalvik-cache.