La razón es muy sencilla, hay programas para ocultar el root. Es lo que se usa para poder tener root y usar aplicaciones que no lo permiten, así se usan las aplicaciones de otros bancos, engañandolas.
Si tienes Knox activado Samsung ya sabe que has modificado el software. Aunque vuelvas a stock Samsung no sabe si lo estás engañando o no, así que decide y con razón no dejar usar Samsung Pay a nadie con Knox, para curarse en salud, ya que con root pueden robarte los datos de pago, dando muy mala imagen a Samsung Pay.
De todas formas desde que salió a la venta el Galaxy S6 se sabía que samsung Pay no funcionaría con Knox subido. Así que no puede haber quejas de esto.
