1) No veo porque no podrías seguir usándolo, con un poco más de cuidado a la hora de separarlo del móvil
2) Parece, por lo leído en el foro, que lo de tramitar la garantía a SONY directamente es la mejor opción
3) Hay varios casos como el tuyo en el foro que han sido reparados en garantía. SONY no pueden saber si ha sido con un cargador "x" o con su base
4) Yo no le quitaría el cristal templado, puesto que nada tiene que ver con la avería del móvil, ni le perjudica en ningún sentido (más bien todo lo contrario)
5) Si al final te entra agua, y detectan que ha sido por esa zona, igual se lavan las manos, o no. Quien sabe