Si estás usando el Rom Manager y has instalado el Clockworkmod dale a la última o penúltima opción para que se instale el recovery alternativo de AmonRa 1.7.0.1. Así lo hice yo y después ya puedes desinstalar el Rom Manager o no usarlo más vaya. Con el AmonRa podrás meter ROMs cocinadas aparte de muchas otras cosas. Si tienes alguna duda pregunta
Edito: Efectivamente las ROMs vienen en formato zip, pero una cosa es recomendable hacer antes de instalarla así por las buenas, primero es recomendable hacer todo esto desde el recovery, particionar la microSD para poder usar el App2SD, hacer un nandroid backup, hacer todos los wipes y por último instalar la ROM. Como tú ya eres root y tienes el recovery instalado te falta lo más fácil, puedes seguir los tutoriales que te indico
aquí y
aquí por si tienes dudas antes de embarcarte en el maravilloso pero adictivo mundo de las ROMs cocinadas, jeje.