Hola Chicos, espero que esto os solucione a algunos el problema con el que yo me encontre.
Parece ser que si instalamos alguna rom de distintas versiones de android, 4.1 a 4.3 o 4.4 por ejemplo, se nos genera una nueva ruta de archivos en la SD donde nuestros nuevos exploradores de archivo no leeran nuestras antiguas carpetas de datos, fotos, audio y demas.
Navegando por XDA me encontre con esto:
http://forum.xda-developers.com/show....php?t=2274218
y solucione mi problema sin formatear o sin perder los datos que anteriormente tenia en la sd del movil, no en la extsd.
En resumen seria entrar en la carpteta /data/media y copiar todas las carpetas a /data/media/0, dejando las carpetas de /0, /legacy y /obb intactas en ese directorio.
Podeis aprovechar para hacer una limpia de carpetas de antiguas app de aquellas que sabeis con seguridad que no sirven ya para nada.
Espero que esto pueda servir de ayuda a alguien.