actualizar a jelly bean teniendo una rom

[gallloo]

Muy buenas, resulta que cuando compre el movil lo rootee y le instale una rom como no echandome una mano por aqui algunos foreros porque yo no me acabo de desenvolver muy bien con la instalacion de roms y toquetear el software del telefono.
Bueno, el caso es que tengo android 4.03 y el propio telefono me ha descargado la nueva version de android jelly bean y me esta pidiendo instalarla, entonces queria saber en que puede afectar que se me actualice la version de android teniendo yo ya instalada una rom y el movil rooteado ¿pierdo las aplicaciones o los privilegios de root?¿en que aspectos afecta fundamentalmente?
Por ultimo como ya se supondra mi movil es el galaxy s2.
Muchisimas gracias por vuestra ayuda

[gallloo]

si me pudierais echar una mano os lo agradeceria.

Un saludo