Hola,
Aunque el teléfono sigue con S-On el problema de fondo era que no podía rootear por completo el terminal e instalar rooms precocinadas. Esto lo he resuelto siguiendo el tutorial "la parte de hacer root" del compañero
anuvviss "http://www.htcmania.com/showthread.php?t=608489" y el problema parece ser que se daba por el recovery instalado, con el nexus recovery v1.1 beta fixed for JB recomedado en este tutorial ya soy root y he instalado una nueva room SuperSENSE-dx5_1.02 sin problemas.
Por lo que el caso esta solucionado.