Vamos por partes:
El problema de las aplicaciones incompatibles me imagino que será con aplicaciones un poco "especiales" es decir aplicaciones como las de Xiaomi o aplicaciones de desarrolladores bastante malillos.
Con el tema de la app Mi Home, en la play store te vas a encontrar versiones muy desactualizadas dependiendo de con que movil o tablet abres la play store. Mi recomendación es que para descargar ese tipo de aplicaciones uses aptoide, pues te vas a encontrar la versión más reciente, que a dia de hoy creo que es la versión Mi Home v5.1.25
Para lo del lag, sería intersante saber si te pasa solo con la funda teclado magnética oficial o si te pasa también al separar la tablet y usarla en formato horizontal. Podrías probar a ver si ese "lag" que cuentas en realidad es que las animaciones de ventanas están en x1 y te dan la sensacion de lentas. Te recomiendo que las pongas todas a x0.5 que es como las tengo yo, o que incluso cambies de launcher. Fundiona de maravilla con Nova Launcher.