Yo las copias de seguridad siempre las tengo automáticas, normalmente detecta todo sin problemas (fotos, calendario, contactos, archivos, etc...) si que es cierto que los datos de las app no se guardan y tienes que volver a iniciar sesión en todas las RRSS.
La mayoría de los juegos suelen hacer guardado en la cuenta con la que hayas iniciado sesión (normalmente Google Play Juegos) y se recuperan los datos.
A la hora de restablecer de fábrica o cambiar de dispositivo al iniciar sesión te aparecerá para restaurar automáticamente, seleccionas la copia de seguridad que quieres restaurar y ya.
Si la copia la has hecho manualmente, tendrás que restaurar tu todo manualmente.