Me contesto a mi mismo, después de casi 4 meses y por si le sirve a alguien: pasé de tener la última estable MIUI V.10.2.1.0 oficial con bootloader desbloqueado y flasheada por MiFlash... a la misma última estable
pero la de EU (no va a haber más actualizaciones de MIUI), que es más livianita y con menos morralla chinorris!. Vía Recovery ZCX he limpiado todo, con todos los Wipes (
incluido el "Wipe System" por el que preguntaba)
y Format Data para limpiar todo como una patena y...
no ha pasado nada! Ha quedado totalmente limpio y luego le metí la misma y última EU V.10.2.1.0 estable y va fantástico. Así que, ya sabéis:
se pueden hacer absolutamente todos los wipes (excepto los de la MicroSD donde tenéis la Rom nueva a instalar, obviamente 
) incluido Wipe System y,
para dejarlo totalmente límpio de la Rom anterior,
es imprescindible hacer también un Format Data desde el Recovery antes de proceder a flashear el zip con la nueva Rom. Y ya con ella instalada, al acabar, para más refinamiento haced los Wipe Dalvik y Wipe Dalvik Cache de rigor. Hasta más!
