Ya he conseguido solucionarlo con el tutorial que teneis aqui titulado "Nuevo método para flashear los KDZ". Pero lo he conseguido porque he cambiado el puerto USB donde conectaba el cable. Lo hacia en el USB 2.0 del frontal del PC de sobremesa y se me ha ocurrido conectarlo a los que van en la parte trasera de la torre. Y en menos de 10 minutos ya lo tenia todo. Y además actualizado a la versión Kitkat 4.4.2, ya que al ser root no pude actualizar via OTA ni de ningún otro modo la 4.1.2 Jelly bean.
Muchas gracias.