Buenas,
En su día actualice varios Redmi 3/3S sin problemas. En mi Redmi 3 Pro tengo la ROM de Carlos Paton y después de un par de años me decidí a actualizar el teléfono a la ultima MIU oficial (9.5.2). Los drivers los tengo correctamente, pero el MiFlash da un error "send configure command failed" cuando lleva unos 60 segundos de actualización.
Por suerte el teléfono sigue operativo, alguna idea de que puede estar pasando? Pruebo mejor a actualizar por fastboot?
Edito para añadir que tengo el bootloader bloqueado. Puede ser ese el problema? En teoría para poner una ROM oficial estable esto no deberia ser un impedimento.