Sí, pero si se te estropea el móvil y tienes que tirar de garantía para repararlo sabrán que está rooteado.
Con Android la elección es simple: rooteo o mantenimiento de garantía.
Que cada cual elija la opción que mejor crea (excepto en esos modelos tipo Nexus donde es posible revertir por completo el root en caso de necesidad de tirar de garantía).