No se exactamente como es la situación que indicas, pero es verdad que en ciertas circunstancias el modo auto no es capaz de controlar bien el balacera de blancos y no queda otra que tirar de manual.
Por ejemplo en interiores con algunas luces incandescente, tinta mucho de amarillo en auto y no hay manera. En cambio en Pro lo pilla bien tocando el balance.