El pilar clave de linux sobre el que se sustenta su seguridad es que los programas se ejecutan en el espacio de usuario, y no como administrador. Si haces todo como administrador se va a tomar por culo la seguridad de linux.
Un simple script con rm -rf /etc/ te puede joder el sistema. Eso ejecutado como usuario no hace nada, pero ay amigo si lo ejecutas como administrador...