Ya se ha solucionado el problema. He descargado desde apkmirror las últimas versiones de los servicios móviles de Huawei (4.0.3.316) y Huawei healt (10.0.5.517) y tras instalarlas ya me llegan las notificaciones sin tener que activar manualmente la aplicación Salud.
Además, desde que hice esto no me ha vuelto a llegar ninguna notificación del WhatsApp por duplicado.