Buenas,
Tienes dos formas simples de hacerlo, que se me ocurran.
- Desactivar la fototeca de iCloud antes de borrar las fotos del iPhone.
- Cerrar sesión de iCloud antes de borrar las fotos.
De todas formas, guardaría aparte las originales del iPhone en un soporte propio, nunca sabes que pueda ocurrir en la nube, aparte que es necesario tener datos o internet.
Un saludo.