Bueno amigo, por partes como jack el destripador, primero mi recomendación es que pases el mp3 a ogg, ocupa menos y al integrarlo cómo tono de sistema lo reconoce sin problema. Ahora el tema de pegar el archivo a system/audio/notifications, parto de la base de que el terminal esta rooteado, con root Explorer copias el ogg/mp3 en cuestión, te vas al raiz del teléfono, luego system/media/audio/notifications activas arriba montar r/o pegas y listo, si dices que no aparece la pestaña de cambiar modo lectura a modo escritura lo único que se me ocurre es que no está bien rooteado o que no has dado permisos de superusuario al root Explorer cuando te los ha pedido. Espero que te sirva de ayuda