no nunca se vuelve a cerrar el bootloader.
solo se cierra por uno de los siguientes motivos y debes hacerlo manualmente:
1º Usando el miunlock (tiene una opcion de revertir el proceso)
2º Usando el miflashtool, este abajo a la derecha donde pones el flash_all en las nuevas versiones de miflashtool sale la opcion de UNLOCK, esta no la marcas y solucionado.