Yo también estaba igual que tu, y voy a intentar darte una explicación.
Para hacerlo sencillo, hay dos tipos de rom Stock de Samsung: CSC Unico(BTU) y MultiCSC (PHE) ((Perdón por alomejor la bestialidad que estoy diciendo pero creo que puede ayudar a entenderlo mejor este tutorial)).
Esas Rom de Samsung tienen una lista de CSC compatibles.
Cuando instalas una rom CSC Único (BTU), si tu antiguo CSC no esta en la lista de CSC que tiene, este se te cambiara por el CSC de la rom (en este caso BTU).
Pero cuando instalas una rom MultiCSC (PHE), tiene 2 formas: si tu CSC se encuentra en la lista y desde un principio no eres PHE no te cambiara el CSC. Y, si no esta en la lista de CSC, te lo cambiara pero NO te lo cambiará a PHE, sino recuerdo mal te cambiará al CSC CYO.