Prueba con otra versión de SuperSU. A mí comenzó a no "funcionar" el rooteo con la 2.76 y supongo que por lo que comentas la 2.78 (esperaba que sí) tampoco parece funcionar. Usa la 2.65 (me pasó lo mismo con el P9 lite) que puedes descargar desde este enlace, luego ya se actualizan los binarios desde el propio android.
https://mega.nz/#!AVxwzSpC!S4h1p2PYp...ZrGQaQ9307CvKM
Aunque es la que está incluida en el script AIO del otro hilo/tutorial.
Confírmame si funciona y lo cambio en el primer post.
Saludos.