Pues claro que no inicia, al formatear System el sistema operativo desaparece, pero por suerte puedes recuperarlo fácilmente ya que tienes TWRP. Baja el siguiente archivo y cópialo tal cuan el la microsd, luego entra en TWRP y le das a install, selecciona Storage 1 y luego el archivo.
https://mega.nz/#!A5kD0SaI!bh_De9ZXT...GjN03C8Z0TrFxQ