Yo lo que leí por ahí, pero que no he corroborado en la web de Apple, es que desde iOS 12 si pones una batería compatible el apartado de “Salud de la batería” deja de funcionar, pero no se altera la funcionalidad del dispositivo ni por ende las actualizaciones del sistema.
Por cierto, el cambio de batería de un 6s en Apple cuesta 55€, lo pone en la web y lo corroboré en tienda hace tres días.