El código de Windows no es open source y, por tanto, no es modificado por ningún fabricante de PCs. El código de Android es modificado y recompilado por los fabricantes.
No tienen nada que ver ambos sistemas operativos. Todos los ordenadores con Windows son iguales a nivel software... mismas ventanas, mismas notificaciones, mismas funcionalidades, etc. Cada smartphone Android tiene cosas diferentes.