Saludos @
atcraw
En primer lugar debo de advertirte que estás en el foro del Mi 4 y no del Mi 3.
El del Mi 3 es éste: http://www.htcmania.com/forumdisplay.php?f=1194
En teoría los procedimientos deberían de ser los mismos para el Mi 3 y el Mi 4 ya que comparten prácticamente el mismo hardware, sin embargo no puedo asegurarlo al 100% ya que no tengo ningún Mi 3 y no he corroborado que funcionen.
Dicho esto, para cambiar la ROM y unificar las particiones, lo más sencillo es usar MiFlash, lo hace todo solo y en 5 minutos.
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=921047
En caso de error mira la solución que he dejado en la guía para la instalación por Fastboot/Miflash.
La ROM Fastboot la puedes descargar desde la página oficial seleccionando tu dispositivo:
http://en.miui.com/a-234.html
(Puede que te redireccione a la pagina web oficial china anunciando MIUI 9. Es un fallo de la web por la inminente MIUI 9. A veces sale y otras no)
Un saludo.