A mi me pasa lo mismo, he bajado el flashtool de la primera pagina, y simplemente he extraido el zip en el escritorio
He instalado la carpeta de drivers, pero ya esta.
Todavia no he conectado el xperia z porque no me ha llegao, pero el programa cuando le doy al rayo para elegir firmware, y ponerlo en flashmode, me sale no se que error de java lang o algo asi.
Esperare a ver si con el telefono conectado todo va bien.....