la verdad es que una vez que estas en TWRP no te cuesta nada hacer los wipes y volver a meter en el listado de zips a instalar la rom y las nuevas gapps... no he probado lo que dices, pero si las gapps estan haciendo que no arranque la rom me imagino que aunque las "sobreescribas" con otras, lo que esta dando el fallo se quede "por ahi"...
venga!
