En lollipop es practicamente imposible cambiar el bootanimation, no se sabe muy bien aun por que persiste el original.
Ahora ya no hay que tocar en system/media, ya que el bootanimation tambien esta en cust/poweron o cust/poweroff, ahi estan los zip de las operadoras y el lriginal, pero aunque lo toqueis no se va a cambiar.