Esa opción de ajustes/batería/iniciar sirve para gestionar el inicio y la ejecución en segundo plano de aplicaciones para ahorrar energía.
Por defecto, se gestionan todas automáticamente, es decir, está el selector activado, desplazado a la derecha, con color azul. En ese caso es el móvil el que se ocupa de todo, de tal manera que si considera que una aplicación está gastando mucha batería, puede quitar la aplicación que sea del segundo plano para ahorrarla.
Yo he desactivado algunas (las que me interesa que no gestione el teléfono) para asegurarme que me llegan todas las notificaciones y que sigue corriendo en segundo plano, tipo WhatsApp, Correo, AccuWeather, TomTom Go, etc...
Por esa razón creo que es al revés... Poner en automático las que se usen de vez en cuando y respecto de las que no nos importa que el móvil pueda cerrarlas para ahorrar batería y/o evitar su inicio con el inicio/reinicio del móvil y poner en manual aquellas que nos interesa que se ejecuten cuando se inicia/reinicia el móvil, que tengan la posibvilidad de un inicio secundario y que puedan ejecutarse sin problemas en segundo plano sin miedo a que el móvil las cierre.
Y para mayor control, entras en el apartado "gestionar manualmente por lotes" ahí decides más pormenorizadamente si quieres que una determinada app se inicie con el teléfono, tenga un inicio secundario o se ejecute en segundo plano o las tres opciones o una o dos de ellas. En este apartado se ponen, automáticamente, todas aquellas apps a las que le quitas la opción de gestión automática.