Kadoc han tocado demasiadas cosas en la 27. MultiROM (MIUI 8.12.27 primaria y crDroid pie de segunda) la AOSP no arranca se queda en bucle en el bootanimation de forma permanente y antes de actualizar la MIUI si iba la AOSP.
Tampoco me deja integrar actualizaciones de app que estaban en /System/... Y la actualización en /data/app. Dice que no tiene espacio en /System.
Es posible que las apps de vitaminada que metes a System no entren por falta de espacio. Haz que el instalador los lleve a /data/app a ver qué pasa. Obviamente lo más gordo está e MIUISystemUI que por narices ha de ir a /System/priv-app para sustituir al original.
No sé si lo de /System/su.d /System/vendor y el build.prop dará problemas ya que tampoco es algo que sea muy pesado debería entrar sin problemas por recovery desde el Zip
EDITO: Más que falta de espacio yo creo que es alguna protección nueva de MIUI. Dudo mucho que un teléfono saludo a la venta este año salga con la partición /System ya tan justa de espacio teniendo mínimo 64Gb de espacio total. Si fuera así ¿En qué coño estaba día pensando Xiaomi para en menos de un año empezar a necesitar reparticionar la memoria para añadir más espacio a /system