La aplicación de música oficial en Cyano es Apollo, pero en esta rom no viene (al ser Slim). Si quieres la subo. Cyanogenmod no trae aplicación de radio, hay que usar Spirit FM, no es una app de streaming de radio, usa el chip de radio del móvil. Si instalas el fix para el forzar cierre de la cámara al grabar video, no se oirá Spirit FM, es un bug que ya está reportado y que en breve estará solucionado.
Lo del whatsapp entra en los ajustes de esa aplicación y desactiva la iluminación LED en las notificaciones. Hay gente que ha preguntado cómo desactivarlo editando ficheros pero no hay nada en claro. Existe una aplicación que desactiva la iluminación por completo, está colgada en el hilo en XDA Developers, aunque a mí no me funciona del todo bien.
EDITO: Aquí tienes Apollo, tienes que bajar el fichero que pone Apollo.apk. Aparte está un tema light de Holo y una versión para GB e ICS:
http://forum.xda-developers.com/show....php?t=2196385