Has probado a una vez instalado todo, meter el Fuelgauge FIx de Bazooka? Esta en el store y es gratuito.
Una vez que este todo instalado deja conectado el cargador o el ordenador y cuando este mas o menos seguro de que la bateria esta a tope, descarga e instala esa app.
Creo que a mi me sirvió con la CM 10.2 con Android 4.3 aunque como estoy cambiando continuamente entre 10.1 y 10.2 no te puedo asegurar en cual estaba ya...