Yo no entiendo mucho pero creo que un ejemplo vale más que 1000 palabras:
con un documento firmado electrónicamente tenemos por un lado un archivo con un documento y por otro un archivo con su firma electrónica. Si por casualidad (y son cosas que pasan) se rompe el link que une los dos archivos, pues se pierde la autencididad del documento y pasa a no valer casi nada. Pierde una parte.
Una app que pierde su archivo odex, también dará problemas. Por eso lo mejor, más cómodo y seguro es tener los dos archivos en un sólo lugar, sobre todo tratandose de rooms cocinadas que no son las oficiales.