No, no es necesario darle permisos a flash-all.sh
Se debe hacer así:
Buscas flash-all.sh, le haces clic derecho, propiedades, y ejecutar como administrador.
Y desde terminal:
cd Escritorio/4.2.2
./flash-all.sh
Y conectar el Nexus con depuración activada..
En algunos casos esto no va, y hay que editar flash-all.sh añadiendo "sudo" delante de fastboot en todos

