Hola pues mira tampoco soy experto en temas android pero bueno te puedo responder si quieres.
No si haces root no es obligatorio instalar ninguna rom, el root sirve para más cosas a parte de para instalar custom rom, también para usar e instalar aplicaciones que no podrías instalar como usuario "normal", yo por ejemplo tenía un huawei e hice root para poder usar una app que me permitiera des-instalar esas aplicaciones que vienen por defecto e instala el fabricante y que de otra manera no se podían quitar.
En este mismo subforo hay un hilo que dice que CyanogenMod está disponible yo lo instale en otro terminal e iba bastante bien, sin quejas, es cuestión de probarlos.
Yo conozco CyanogenMod y miui habrá muchas más claro.
Pues según tengo entendido algunas están optimizadas para funcionar mejor en según que modelos de procesadores, ahorrar batería... en realidad no estoy muy puesto en este tema pero bueno son una alternativa a las roms oficiales en definitiva.
Si te refieres a que deja de recibir actualizaciones de fabricante, por supuesto, pero las custom rom también se actualizan y se depuran, pero lo más importante es que si haces root e instalas una custom rom pierdes la garantía del teléfono, así que piénsatelo bien antes de nada.
Saludos y espero que te sea de ayuda.