Segun he mirado, por varios foros, esta relacionado con algun virus o similar.
Prueba lo siguiente: vete al gestor de aplicaciones busca la aplicacion System UI, desinstala. Veras que en el escritorio los iconos se han puesto mal.
Los vuelves a arrastrar al escritorio y deberia ir bien.
Y si restauras las aplicaciones al cambiar de ROM, las de sistema, tambien te puede fallar por ahi