Después de crear el script de montaje reiniciaste (antes de empezar a enlazar apps) para probar sí funcionaba bien?
Puedes probar rehacer el script de montaje en otro formato. Qué formato depende del móvil y rom. Fat32 y Ext2 suelen ser bastante compatibles con stock roms, ext3 y ext4 son más para custom roms (sobre todo basadas en AOSP).