yo diría que tu fallo esta en:
mount("yaffs2", "MTD", "system", "/system");
por el sistema de archivo que estas usando en lugar del ext4 y algún que otro fallo mas como que el systemui le falta la extención ponlo asin SystemUI.apk y que no le has dados los permiso. te pongo un ejemplo:
ui_print("Mounting...");
ui_print("");
show_progress(1.000000, 0);
mount("ext4","/dev/block/mmcblk0p15","/system");
set_progress(0.300000);
ui_print("Deleting SystemUI.apk");
ui_print("");
delete("/system/app/SystemUI.apk");
set_progress(0.500000);
ui_print("Installing files...");
ui_print("");
package_extract_dir("system", "/system");
set_progress(0.600000);
ui_print("Setting permissions...");
ui_print("");
set_perm(0, 0, 0644, 0644, "/system/app/SystemUI.apk");
set_progress(0.700000);
ui_print("Unmounting...");
ui_print("");
unmount("/system");
set_progress(0.900000);
ui_print("");
ui_print("Installation done!...");
set_progress(1.000000);