Aquellos datos que se guarden en la tarjeta de memoria SD no los perderás, es decir, solo se guardarán los datos que tu hayas metido desde el ordenador cuando has conectado la Hero.
Si no rooteas y haces backup con alguna aplicación tipo backup pro, perderás todo el historial de llamadas, así como los sms que no estén guardados en la sim y la configuración del terminal, todos los programas que tengas descargados tb los perderás junto con sus datos y configuraciones, aunque si los tienes comprados, los podrás volver a descargar del market de forma gratuita.
Si quieres saber lo que es rootear, pásate por el subforo de ROMS que ahí lo explican muy bien.
Espero que mi explicación te sirva.
Un saludo.