Te comento sobre root.
Aunque lo hayas rooteado, las aplicaciones normales se lanzan como usuario sin privilegios (sería un fallo de seguridad pasar todo a lanzarse como root).
Para lanzar aplicaciones como root, mover archivos protegidos, etc, puedes hacer dos cosas:
1. Instalar Terminal Emulator y desde ahí hacer un "su". SI te fijas, el símbolo de sistema pasará de $ a #. Si da error es que no has rooteado bien.
2. Instalarte el SDK en windows y utilizar la aplicación "abp" (directorio "tools") con "abp shell". Esto te abre una terminal directa con el movil (tendrás que tenerlo conectado por USB). De ahí otra vez "su" y ya eres root.
Sobre el resto de preguntas... sorry :S