Sí, parece un poco raro, amigo Persuader. Si formateaste la tarjeta nueva (FAT32), y le copiaste lo que tenías en la antigua (previa visualización de archivos ocultos), los archivos raros ya deberían estar con seguridad en la tarjeta antigua. Otra cosa es que los estés visualizando en ambas. También se me ocurre que puedas estar usando distintos sistemas operativos. Por ejemplo si usas Mac y PC como es también mi caso, encontrarás que de repente aparencen archivos del tipo ".cosasraras" cuando los ves en Windows.