Por lo que dices, ¿si que puedes acceder a la sd para escuchar música y ver los archivos, pero no puedes pasar las aplis a la sd?
Con qué programa estás intentando pasar las aplicaciones a la sd? Que yo sepa, no existe ningún programa que no sea un backup que te pase las aplis a la SD, el app2sd viene ya configurado de serie, tu no tienes que hacer nada para pasar las aplicaciones.
También, aunque seguro que ya lo sabes, te recuerdo que para poder pasar las aplicaciones a la sd es imprescindible que tengas correctamente hechas las particiones ext(2 o 3), swap y fat.