Platbitron, la imagen de google solamente flashea una serie de particiones (bootloader, radio, recovery, system, cache y userdata) por lo que no arreglaría un problema con el persist que es una partición diferente.
En todo caso antes de reemplazar el móvil lo al menos le echaría un vistazo al persist a ver como está ahora.
En cuanto a porque se ha estropeado, vete a saber. En la nexus 10 el factory (equivalente al persist del nexus 4) viene montado como read-only por defecto mientras que el persist viene como read-write. Nunca he sabido por que es así, pero intuyo que es la fuente de los problemas de MAC que se dan con este móvil.