Hola albter, sí que se puede, yo nunca lo he hecho; si lo hiciera, lo haría así:
1. Como siempre, haría un backup desde el recovery (y copiaría otra vez todos los datos con el Titanium + aplicaciones nuevas) .
2.
(Recomendado) Si quieres empezar de cero, no hay ningún problema, haces los wipes e instalas normal.
Supongo que así así te funcionará prefecto, luego sigues con link 2sd etc. (Si tuvieras problemas podrías incluir wipe dalvick cache -normal y otra vez con la herramienta especial para int2ext- antes de reinstalar la rom)
3.
(Arriesgado) Puedes desinstalar aplicaciones hasta que uses menos memoria interna que la del ACE y luego borrar en system etc init.d el script 40int2ext y reiniciar. No estoy seguro de que así te funcione.
Saludos y buena suerte.